NEUROLOGIE PRO PRAXI / Neurol. praxi. 2024;25(4):282-286 / www.neurologiepropraxi.cz 286 HLAVNÍ TÉMA Současné standardy molekulárně‑patologického testování nádorů centrálního nervového systému Pokud chceme získat metylační profil nádorové léze, pak je nutné využít komplexnějších technik, jako je DNA metylační „array“ (Illumina, San Diego, CA, USA). Jedná se o robustní komplexní technologii, kterou lze využít i pro vzorky s nižší kvalitou DNA (FFPE vzorky), což je nesporná výhoda v diagnostice CNS nádorů. Optimální zastoupení nádorových buněk pro tuto metodu je > 70 % (Capper et al., 2018; Serrano et Snuderl, 2018). K následnému zařazení nádorů CNS do typů a subtypů dle metylačního profilu se využívá klasifikátor Brain classifier verze 12.8 dostupný z https://www.molecularneuropathology.org. Metylační profil u nádorových onemocnění může odhalit i vzácné subtypy onemocnění a je tak dalším dílkem do mozaiky integrované diagnózy (Capper et al., 2018; https://www.molecularneuropathology.org/ [online], cit 19. 12. 2023. Závěr Diagnostika nádorů CNS se sice stále opírá o klasické histologické a IHC metody, avšak v posledních letech pronikají do rutinního diagnostického procesu čím dál tím více i molekulárně genetické metody. Ty nejen napomáhají především přesnější klasifikaci, ale mohou mít i prediktivní, prognostický a terapeutický význam. Klíčové geny pro molekulární profilování jednotlivých typů jsou shrnuty v tabulce 1. K diagnostice nádorů CNS je nutné přistupovat komplexně a multidisciplinárně. Jednotlivá vyšetření se vzájemně doplňují a společně tvoří tzv. integrovanou diagnózu. I přesto mohou být některé případy složité z hlediska přesného určení jednoznačné diagnózy. V posledních letech napomáhá zpřesnění diagnózy některých nádorových lézí a klinické stratifikaci pacientů také DNA metylační profilování. Určení typu nádoru CNS dle DNA metylačního profilu je nejpřínosnější u histologicky nejednoznačných případů, které mohou nést cílenou alteraci pro terapii. Bez úzké spolupráce patologa, neurochirurga, neuroonkologa a molekulárního biologa již není diagnostika nádorů CNS vůbec možná. Financování Tato studie vznikla za podpory MZ ČR– DRO: Koncepční rozvoj výzkumné organizace, Všeobecná Fakultní nemocnice Praha (VFN, 00064165); Fakultní Thomayerova nemocnice, Praha (TUH, 00064190) a Univerzity Karlovy (Projekt Cooperatio Medicínská diagnostika) a Interního grantu FNKV 2023. LITERATURA 1. Archer FUSIONPlex Pan Solid Tumor v2 panel https://eu‑ .idtdna.com/pages/products/next‑generation‑sequencing/ archer‑ngs‑assay‑solutions/solid‑tumor‑research/archer ‑fusionplex‑pan‑solid‑v2-panel [Internet] [Cit. 21. 12. 2023]. Available from: https://eu.idtdna.com/pages/products/next ‑generation‑sequencing/archer‑ngs‑assay‑solutions/solid ‑tumor‑research/archer‑fusionplex‑pan‑solid‑v2-panel. 2. Capper D, Jones DTW, Sill M, et al. DNA methylation‑based classification of central nervous system tumours. Nature. 2018;555(7697):469-474. https://doi.org/10.1038/nature26000. 3. Capper D, Stichel D, Sahm F, et al. Practical implemen‑ tation of DNA methylation and copy‑number‑based CNS tumor diagnostics: The Heidelberg experience. Acta Neuropathologica. 2018;136(2):181-210. https://doi.org/10.1007/ s00401-018-1879-y. 4. MolecularNeuropathology.org – The platform for next ge‑ neration neuropathology [Internet]. [Cit. 19. 12. 2023]. Avai‑ lable from: z https://www.molecularneuropathology.org/. 5. Mrcholland.com. [Internet] [Cit. 19. 12. 2023]. Available from: https://www.mrcholland.com/. 6. Koblížek M, Zámečník J. Nádory CNS dětí – nový pohled. Neurol. praxi. 2024;25(4):263-266. 7. Li MM, Datto M, Duncavage EJ, et al. Standards and Guideli‑ nes for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants in Cancer: A Joint Consensus Recommendation of the Asso‑ ciation for Molecular Pathology, American Society of Clinical Oncology, and College of American Pathologists. The Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2017;19(1):4-23. Available from: https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2016. 10. 002. 8. Louis DN, Perry A, Wesseling P, et al. The 2021 WHO Classi‑ fication of Tumors of the Central Nervous System: A summa‑ ry. Neuro‑Oncology. 2021;23(8):1231-1251. Available from: htt‑ ps://doi.org/10.1093/neuonc/noab106. 9. Serrano J, Snuderl M. Whole Genome DNA Methylation Analysis of Human Glioblastoma Using Illumina BeadArrays. Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2018;1741:31-51. Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7659-1_2. 10. Schouten JP, McElgunn CJ, Waaijer R, et al. Relative quantification of 40 nucleic acid sequences by multiplex ligation‑dependent probe amplification. Nucleic Acids Research. 2002;30(12):e57-e57. https://doi.org/10.1093/nar/gnf056. 11. Smrčka M, Belanová R, Fadrus P, et al. KDP: Gliomy moz‑ ku – diagnostika a léčba [online]. Praha: ÚZIS ČR, 2020. [Cit. 21. 12. 2023]. Available from: https://kdp.uzis.cz. 12. Švajdler M, Švajdler P, Koleják R, et al. Praktická diagnos‑ tika nádorov CNS podľa WHO klasifikácie 2021: Všeobec‑ né zmeny a diagnostika difúznych gliómov. Neurol. pra‑ xi. 2024;25(4):256-262. 13. Thorvaldsdóttir H, Robinson JT, Mesirov JP. Integrati‑ ve Genomics Viewer (IGV): High‑performance genomics data visualization and exploration. Briefings in Bioinformatics. 2013;14(2):178-192. Available from: https://doi. org/10.1093/bib/bbs017. 14. WHO Classification of Tumours Editorial Board. (2021). World Health Organization Classification of Tumours of the Central Nervous System (5. vyd.). Lyon: International Agency for Research on Cancer. 568 s. ISBN 9789283245087. VĚRNÝM ČTENÁŘŮM ZAZNĚLO NA 21. SYMPOZIU PRAKTICKÉ NEUROLOGIE V BRNĚ 6.–7. 6. 2024 ZAZNĚLO NA 21. sympoziu praktické neurologie v Brně Hotel International 6.–7. 6. 2024 www.solen.cz | Suppl. D | ISBN 978-80-7471-500-6 | 2024
RkJQdWJsaXNoZXIy NDA4Mjc=